More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1679 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  88.89 
 
 
99 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  81.01 
 
 
90 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  75 
 
 
95 aa  136  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  70.79 
 
 
98 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  70.79 
 
 
98 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  75.61 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  71.08 
 
 
104 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  71.43 
 
 
101 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  75.61 
 
 
103 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  74.39 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  75.61 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  70 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  71.95 
 
 
111 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  70.93 
 
 
92 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  70.93 
 
 
92 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  66.67 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  61.7 
 
 
94 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  61.7 
 
 
94 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  70.73 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  70.73 
 
 
99 aa  123  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  63.44 
 
 
99 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  68.54 
 
 
98 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  67.02 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  79.27 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  68.29 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  64.84 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  58.24 
 
 
110 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  62.92 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  73.17 
 
 
102 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  57.78 
 
 
97 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  64.2 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  62.03 
 
 
95 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  56.98 
 
 
97 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  60 
 
 
196 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  60.76 
 
 
95 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  57.32 
 
 
82 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  57.32 
 
 
82 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  61.8 
 
 
97 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  57.5 
 
 
202 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
245 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
250 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
250 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  57.5 
 
 
222 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  55 
 
 
81 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
222 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  51.85 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  55 
 
 
217 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  55.17 
 
 
89 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  54.43 
 
 
203 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  53.09 
 
 
82 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  52.5 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  49.38 
 
 
96 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  48.15 
 
 
90 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  56.96 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  52.38 
 
 
88 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  52.56 
 
 
88 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  52.87 
 
 
87 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  54.43 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  47.83 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  58.67 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  51.25 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  49.41 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  50 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  53.16 
 
 
86 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 
108 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  50.59 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  45.12 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  51.28 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  45.65 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  46.34 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  43.9 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  53.09 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  46.43 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  45.45 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  40.86 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  54.43 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  45 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  55.7 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  45.98 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  46.91 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  47.13 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  45.12 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  45 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  47.44 
 
 
77 aa  77  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  46.84 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  50.63 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  46.25 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  44.83 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  53.33 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  51.25 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  50.63 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  51.25 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>