More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8451 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  100 
 
 
76 aa  154  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  49.33 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  48 
 
 
455 aa  82  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  48.68 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  49.32 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  47.95 
 
 
88 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  45.33 
 
 
441 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  45.21 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06074  polyadenylation factor subunit CstF64, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09100)  51.35 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.4649  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  40 
 
 
524 aa  70.5  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  46.58 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  43.84 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  41.33 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  47.37 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  43.84 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  47.37 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  45.21 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  43.84 
 
 
250 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  43.84 
 
 
250 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  45.21 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  46.58 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  44 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  45.21 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  36 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  36 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  43.42 
 
 
552 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  45.21 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  43.84 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  39.73 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  42.47 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  42.47 
 
 
222 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  42.47 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  45.21 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
203 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  43.84 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  39.73 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  42.47 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  36.49 
 
 
387 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
217 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
101 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  45.21 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  39.73 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>