294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06074 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06074  polyadenylation factor subunit CstF64, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09100)  100 
 
 
293 aa  580  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.4649  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44112  predicted protein  31.58 
 
 
234 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  51.35 
 
 
76 aa  92.4  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  50 
 
 
86 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  44.44 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
90 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
88 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35.23 
 
 
116 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
88 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
88 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
110 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  36.84 
 
 
441 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
92 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  39.08 
 
 
151 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  29.63 
 
 
155 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  37.35 
 
 
160 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  32.43 
 
 
99 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 
82 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
101 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  36.36 
 
 
125 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  32.05 
 
 
112 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  39.24 
 
 
161 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 
115 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  32.05 
 
 
107 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
90 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 
102 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  30.39 
 
 
97 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
147 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  32.18 
 
 
151 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  34.25 
 
 
96 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  34.25 
 
 
182 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
104 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  39.19 
 
 
152 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
87 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
104 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
148 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  36 
 
 
524 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  35.62 
 
 
97 aa  59.3  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 
96 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
98 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
88 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
98 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
88 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
146 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
88 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  34.57 
 
 
82 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  34.57 
 
 
82 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 
114 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 
100 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
160 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
86 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
90 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  31.08 
 
 
90 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
81 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  34.25 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  34.67 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 
89 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 
99 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
103 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  31.58 
 
 
140 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
207 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.76 
 
 
109 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  38.36 
 
 
632 aa  57  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  30.26 
 
 
134 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
176 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
87 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
149 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
155 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 
156 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  30.49 
 
 
87 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
152 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
88 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 
103 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
90 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  30.49 
 
 
155 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 
112 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 
373 aa  56.2  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
90 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
157 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  29.73 
 
 
856 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 
90 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
154 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
154 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
154 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
153 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
154 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30.26 
 
 
151 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 
143 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  30.95 
 
 
217 aa  55.8  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
101 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  32.43 
 
 
107 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>