289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00130 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  100 
 
 
455 aa  863    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  54.05 
 
 
86 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  48 
 
 
76 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  43.02 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06074  polyadenylation factor subunit CstF64, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09100)  53.85 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.4649  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44112  predicted protein  39.09 
 
 
234 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
90 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
88 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  39.73 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  39.73 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  36.26 
 
 
97 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
92 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
207 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  36.46 
 
 
107 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
95 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
95 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
98 aa  64.7  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.62 
 
 
173 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  37.21 
 
 
90 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.65 
 
 
90 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
90 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.82 
 
 
88 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  34.12 
 
 
104 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.36 
 
 
245 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
90 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  39.13 
 
 
116 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
111 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  38.36 
 
 
103 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  39.73 
 
 
103 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
196 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 
90 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  36.36 
 
 
97 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 
105 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
115 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.95 
 
 
96 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
221 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  36.99 
 
 
82 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
104 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  35.23 
 
 
605 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 
82 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
95 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  39.73 
 
 
103 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 
90 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  38.37 
 
 
89 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  33.72 
 
 
101 aa  60.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  34.44 
 
 
94 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  34.44 
 
 
94 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 
202 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
90 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
88 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  32.22 
 
 
673 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
81 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  34.52 
 
 
81 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  39.08 
 
 
87 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  37.65 
 
 
95 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  36.17 
 
 
97 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 
101 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7191  predicted protein  30.3 
 
 
217 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.373889 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  34.09 
 
 
223 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
89 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
90 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  31.25 
 
 
195 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  25.56 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
148 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 
94 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  30.59 
 
 
100 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  36.96 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.62 
 
 
222 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
102 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
90 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35.63 
 
 
109 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
99 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
150 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  36.9 
 
 
114 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  37.04 
 
 
151 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
176 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
94 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 
114 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  29.06 
 
 
279 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  32.58 
 
 
87 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  31.91 
 
 
195 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
125 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
104 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
122 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
137 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  35.56 
 
 
572 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
175 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
88 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  37.33 
 
 
819 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  32.22 
 
 
98 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  30.77 
 
 
477 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  33.75 
 
 
122 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  32.56 
 
 
152 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  35.23 
 
 
99 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  34.72 
 
 
151 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  36.59 
 
 
82 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  31.51 
 
 
96 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>