More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1274 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  100 
 
 
112 aa  220  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  100 
 
 
107 aa  210  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  43.27 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  46.15 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  51.9 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  48.05 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  41.9 
 
 
102 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  41.9 
 
 
102 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  42.55 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  46.25 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  46.32 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  50.63 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  49.37 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  46.05 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  50.63 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  49.37 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  43.3 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  46.84 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  46.05 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  48.1 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  43.18 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  43.18 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  44.19 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  47.37 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  48.05 
 
 
83 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  46.05 
 
 
90 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  46.58 
 
 
90 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  46.84 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  41.41 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  41.76 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  41.76 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  46.05 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  49.32 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  48.15 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  46.15 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  45.57 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  44.74 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  44.44 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  45.12 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  43.53 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  42.22 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  45.21 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  43.53 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  41.76 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  45.05 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  43.04 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  35.16 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  42.11 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.16 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  40.43 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  37.35 
 
 
441 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  36.25 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  47.37 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  39.78 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  42.68 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  36.7 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  39.08 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 
480 aa  70.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  41.38 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  42.11 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  35.42 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  44.3 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  45.45 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  38.67 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  41.98 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  38.71 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>