More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4357 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 		 97 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  84.54 
 
 		 97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  70.1 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  66.67 
 
 		 94 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  66.67 
 
 		 94 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  65.62 
 
 		 99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  63.27 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  60.82 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  60.82 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  61.39 
 
 		 101 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  65.88 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  61.46 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  56.44 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  60.2 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  62.65 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  55.67 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  58.95 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  58.95 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  62.2 
 
 		 111 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  57.78 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  64.63 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  60.24 
 
 		 103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  58.54 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  52.53 
 
 		 99 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  57.58 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  60.98 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  60.92 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  52.22 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  52.63 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  66.27 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  53.85 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  62.96 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  44.33 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  53.25 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  53.09 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  53.25 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  48.75 
 
 		 196 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  48.75 
 
 		 173 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  45.36 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  50 
 
 		 202 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  47.56 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  48.75 
 
 		 250 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  47.56 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  48.75 
 
 		 250 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  47.5 
 
 		 245 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  44.44 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  47.5 
 
 		 222 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  47.5 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  43.75 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  45 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  45.45 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  48.78 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  50.67 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  45.98 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  46.34 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  46.91 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  44.19 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  43.37 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  46.99 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  44.05 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  42.68 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  39.58 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  43.75 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  43.88 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  43.88 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  40.74 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  43.21 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  46.25 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 		 241 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  43.75 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  41.03 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  44.87 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  46.84 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  40.4 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  46.05 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  44.87 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  40.24 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  46.67 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  42.27 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  35.05 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  39.76 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  38.27 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  38.82 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>