More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39629 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  54.05 
 
 
455 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  49.33 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  45.45 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  44 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  43.42 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  42.86 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  41.56 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  41.56 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  40 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  40 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  41.77 
 
 
441 aa  70.5  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  42.35 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  42.35 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  42.35 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  42.35 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  45.57 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  41.33 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  40 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  37.04 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  40.79 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  41.33 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  39.51 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  42.67 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  35 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  35 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
99 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
176 aa  67  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
181 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.71 
 
 
176 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  44 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06074  polyadenylation factor subunit CstF64, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09100)  50 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.4649  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  38.82 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.97 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.71 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  44.16 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  38.67 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
373 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44112  predicted protein  48.65 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  35.44 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  39.74 
 
 
524 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.06 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>