200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20857 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  100 
 
 
687 aa  1401    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  28.61 
 
 
552 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  29.98 
 
 
516 aa  134  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 
615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  25.26 
 
 
352 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  44.44 
 
 
481 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  28.06 
 
 
328 aa  63.9  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  24.26 
 
 
319 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 
373 aa  62.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  25.25 
 
 
453 aa  61.2  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  36.36 
 
 
434 aa  60.8  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
89 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  44.83 
 
 
559 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  28.06 
 
 
632 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  26.67 
 
 
441 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  35.8 
 
 
182 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  41.33 
 
 
90 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
90 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  46.55 
 
 
480 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  59.3  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
157 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.52 
 
 
107 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  28.48 
 
 
690 aa  58.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
90 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
114 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  36.78 
 
 
112 aa  58.2  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  22.13 
 
 
651 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40.85 
 
 
99 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  39.44 
 
 
162 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57807  predicted protein  34.04 
 
 
383 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0302105 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  30.67 
 
 
732 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
104 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  31.94 
 
 
173 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  40.85 
 
 
149 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  36.59 
 
 
91 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
95 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  22.54 
 
 
477 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  40.85 
 
 
90 aa  55.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  32.39 
 
 
125 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  27.5 
 
 
605 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  40.85 
 
 
176 aa  54.7  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  40.85 
 
 
155 aa  55.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
94 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
94 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  31.94 
 
 
196 aa  54.3  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  40.85 
 
 
151 aa  54.3  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  26 
 
 
499 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
176 aa  54.3  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  26.88 
 
 
246 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  42.03 
 
 
152 aa  54.3  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
132 aa  53.9  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  31.94 
 
 
250 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
81 aa  53.9  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.94 
 
 
250 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
90 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
88 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  27.27 
 
 
155 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  35.21 
 
 
122 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
99 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  32.47 
 
 
90 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  31.94 
 
 
97 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
122 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.56 
 
 
245 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
90 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
148 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
150 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
99 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  26.17 
 
 
1290 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01188  nuclear mRNA splicing factor-associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10920)  32.94 
 
 
396 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  31.51 
 
 
97 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  31.94 
 
 
103 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  36.99 
 
 
134 aa  52.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
102 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
102 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
175 aa  52.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
181 aa  52.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04346  ribosomal biogenesis protein Gar2 (AFU_orthologue; AFUA_4G06350)  32 
 
 
445 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
207 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  32.43 
 
 
455 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  33.73 
 
 
223 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  31.94 
 
 
103 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
88 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.27 
 
 
202 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  24.14 
 
 
572 aa  51.6  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03490  splicing factor u2af-associated protein 2, putative  31.52 
 
 
489 aa  51.6  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
111 aa  51.2  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 
104 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.21 
 
 
76 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  31.94 
 
 
103 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  31.94 
 
 
81 aa  50.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  30.56 
 
 
102 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
98 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  36.59 
 
 
89 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  31.58 
 
 
95 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
88 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  27.78 
 
 
102 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>