173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02130 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  36.71 
 
 
76 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  30.12 
 
 
477 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  35.8 
 
 
455 aa  55.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  36.14 
 
 
97 aa  55.1  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  32.5 
 
 
434 aa  55.1  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  33.73 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
149 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
108 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  33.73 
 
 
687 aa  52  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
155 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.63 
 
 
552 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  33.72 
 
 
124 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  33.72 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
90 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
137 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  32.1 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  31.25 
 
 
453 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  28.12 
 
 
102 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  34.95 
 
 
524 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  30 
 
 
450 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  31.4 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
122 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  32.91 
 
 
104 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  31.91 
 
 
119 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
90 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  32.91 
 
 
95 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
104 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.56 
 
 
123 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
132 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  32.91 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
90 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
150 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  34.18 
 
 
328 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  30.77 
 
 
97 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
90 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  29.63 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  30.49 
 
 
732 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
121 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
82 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.1 
 
 
151 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
88 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  34.62 
 
 
82 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
121 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  32.5 
 
 
319 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  34.62 
 
 
277 aa  48.5  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  31.65 
 
 
95 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  35.71 
 
 
128 aa  48.5  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  30.23 
 
 
175 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  35.71 
 
 
129 aa  48.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
81 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
89 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  26.83 
 
 
673 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 
92 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 
92 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 
109 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  32.1 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  30.93 
 
 
97 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 
90 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  33.33 
 
 
632 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  34.38 
 
 
152 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
85 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
90 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
85 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  35.94 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
1221 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  29.35 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  26.83 
 
 
605 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  30.59 
 
 
95 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
90 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50310  predicted protein  33.33 
 
 
699 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.049035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
88 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
81 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05009  RNA-binding protein (Nab3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09770)  32.5 
 
 
888 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 
90 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
101 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  30.38 
 
 
116 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
103 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  29.89 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  29.63 
 
 
353 aa  45.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 
102 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
111 aa  45.1  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  29.07 
 
 
393 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  36.25 
 
 
819 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  34 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  31.33 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
95 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30.26 
 
 
143 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 
89 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>