More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1510 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 		 81 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  85.19 
 
 		 81 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  75 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  69.14 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  70 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  70 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  72.15 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  72.15 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  69.14 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  65 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  61.25 
 
 		 222 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  61.25 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  60 
 
 		 245 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  61.25 
 
 		 217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  57.5 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  61.25 
 
 		 250 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  61.25 
 
 		 250 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  60.76 
 
 		 203 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  58.75 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  58.75 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  57.5 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  56.25 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  56.25 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  56.25 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  55.7 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  52.5 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  51.25 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  52.5 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  55 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  50.62 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  52.5 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  51.25 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  52.5 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  52.5 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  55 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  53.75 
 
 		 99 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  48.75 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  52.5 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  46.25 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  51.25 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  50 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  46.25 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  44.16 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  44.3 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  40 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  43.04 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  43.02 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  41.03 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  46.25 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  43.59 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  43.59 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  40 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  38.75 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  40 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  44.3 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  42.31 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  39.74 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  37.5 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>