261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03870 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  70 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  41.58 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  34.06 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  40.51 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  31.96 
 
 
441 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  41.56 
 
 
107 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.63 
 
 
157 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  42.5 
 
 
82 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  41.56 
 
 
112 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
88 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
90 aa  62.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  41.77 
 
 
114 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
89 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  38.96 
 
 
95 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
108 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  42.5 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
90 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
88 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
90 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
104 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
114 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
91 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
90 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 
85 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
94 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  48.44 
 
 
81 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
125 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  39.71 
 
 
90 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  37.18 
 
 
90 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
221 aa  58.9  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
88 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
115 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 
87 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
88 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  36.9 
 
 
99 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  38.27 
 
 
87 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
101 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 
92 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
122 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
90 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  32.94 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  41.43 
 
 
122 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
149 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
155 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  43.55 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
90 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  41.18 
 
 
143 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  34.48 
 
 
176 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
99 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
90 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
95 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
88 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  36 
 
 
724 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  43.08 
 
 
84 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35 
 
 
109 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  34.15 
 
 
97 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  45.31 
 
 
89 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  39.77 
 
 
117 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
175 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  33.73 
 
 
119 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
146 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
207 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  36.47 
 
 
162 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
102 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  38.36 
 
 
76 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  34.12 
 
 
89 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
160 aa  55.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  37.14 
 
 
89 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  45.9 
 
 
552 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  42.19 
 
 
81 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  38.16 
 
 
104 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
103 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  36.78 
 
 
96 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  32.38 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 
102 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  36.78 
 
 
461 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 
102 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
86 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
90 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
96 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 
102 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  32.1 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 
90 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  32.76 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
176 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
103 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
103 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  39.06 
 
 
82 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
132 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
95 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
101 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
150 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
89 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  34.48 
 
 
134 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  29.21 
 
 
477 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>