282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1059 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 		 82 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  76.25 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  77.22 
 
 		 95 aa  130  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  76.25 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  75.95 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  70 
 
 		 81 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  68.75 
 
 		 81 aa  120  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  65 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  61.25 
 
 		 222 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  58.54 
 
 		 250 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  58.54 
 
 		 250 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  58.54 
 
 		 196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  56.1 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  60 
 
 		 222 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  57.5 
 
 		 245 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  56.1 
 
 		 202 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  58.75 
 
 		 217 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  59.26 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  59.49 
 
 		 203 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  57.32 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  57.32 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  58.54 
 
 		 99 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  57.32 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  56.25 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  56.1 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  56.96 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  54.88 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  54.88 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  52.44 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  53.75 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  51.22 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  53.75 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  53.75 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  48.78 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  51.25 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 102 aa  92  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  51.25 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  50 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  51.22 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  52.5 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  47.56 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  45.68 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  42.86 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  46.84 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  43.9 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  45.45 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  42.86 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  42.31 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  46.15 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  42.86 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 181 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  42.86 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  45 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  45.57 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  44.87 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  43.59 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  40.79 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  40.79 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  45.57 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  37.04 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  46.84 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>