More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2851 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  84.54 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  72.16 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  68.37 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  65.59 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  65.59 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  65.98 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  65.98 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  65.62 
 
 		 99 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  63.37 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  62.5 
 
 		 99 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  68.24 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  59.41 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  61.22 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  59.79 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  63.16 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  65.85 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  63.16 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  63.41 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  56.67 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  66.27 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  61.8 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  68.29 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  63.86 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  60.61 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  63.22 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  55.56 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  64.63 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  67.47 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  54.74 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  57.69 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  66.67 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  56.25 
 
 		 196 aa  94.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  45.36 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 		 202 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 		 250 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 		 250 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  53.25 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  51.85 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  50 
 
 		 245 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  51.95 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  46.39 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  51.25 
 
 		 222 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 		 222 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  48.75 
 
 		 217 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  47.56 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  47.56 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 115 aa  84.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  49.35 
 
 		 203 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  46.25 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  50.57 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  56 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  43.21 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  50.6 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  46.46 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  49.38 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  48.19 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  45.12 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  45 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  48.78 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  50.62 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  48.1 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  46.34 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  43.37 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  46.99 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  49.37 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  49.37 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  43.18 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  43.59 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  49.33 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  41.98 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  41.98 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  38.14 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  43.21 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  41.98 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  40.74 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  43.21 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  45 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  42.35 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  43.75 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  41.84 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  41.67 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  41.84 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>