237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1566 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 
184 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  57.83 
 
 
105 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
103 aa  97.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1256  RNP-1 like RNA-binding protein  60 
 
 
86 aa  91.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.737942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 
112 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  42.7 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  44.59 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.96 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
85 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  41.25 
 
 
95 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 
88 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  48.57 
 
 
160 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
137 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 
87 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  37.8 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
88 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
101 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
102 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 
85 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  39.02 
 
 
123 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
102 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  40.48 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  45.95 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  43.66 
 
 
99 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.06 
 
 
90 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 
122 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.26 
 
 
116 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  42.35 
 
 
89 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  41.56 
 
 
114 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
104 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 
241 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
88 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.74 
 
 
115 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
89 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  35.37 
 
 
140 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  37.35 
 
 
441 aa  57.8  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  39.29 
 
 
87 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
88 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  36.36 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  33.75 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  38.46 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
121 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  40.74 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
90 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.03 
 
 
90 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
121 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
99 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 
87 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
90 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  38.36 
 
 
143 aa  54.3  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
124 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
88 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  31.09 
 
 
477 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  41.77 
 
 
89 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
97 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
92 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.93 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  36.14 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  37.66 
 
 
524 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  45.71 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
83 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  45.71 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
95 aa  52  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
1221 aa  52  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
88 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
88 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  39.53 
 
 
151 aa  51.6  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  37.14 
 
 
96 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
146 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  38.36 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  33.33 
 
 
1290 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  38.46 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  30.37 
 
 
552 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 
103 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
89 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  44.29 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  32.91 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
103 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
109 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  33 
 
 
102 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>