240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55837 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  100 
 
 
453 aa  937    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  46.88 
 
 
477 aa  322  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  50.58 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  27.41 
 
 
690 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  23.9 
 
 
572 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  34.16 
 
 
393 aa  93.2  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  30.2 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  25.84 
 
 
732 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  27.57 
 
 
319 aa  87  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  28.95 
 
 
328 aa  86.3  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  27.62 
 
 
245 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  25 
 
 
605 aa  84  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  26.92 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  26.99 
 
 
673 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  27.12 
 
 
559 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  26.78 
 
 
632 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  41.77 
 
 
162 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  30.41 
 
 
246 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  32.97 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  42.31 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  40.22 
 
 
119 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  23.59 
 
 
706 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
102 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
102 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  28.1 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  37.8 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  37.21 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  40.79 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  38.37 
 
 
116 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
132 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  40 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  41.33 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
92 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
175 aa  65.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
181 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 
480 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
148 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25.95 
 
 
552 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
105 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  25.13 
 
 
687 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
137 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
104 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
152 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  23.16 
 
 
450 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  35.42 
 
 
98 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
92 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  43.9 
 
 
103 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  27.04 
 
 
161 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 
92 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
150 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 
108 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
140 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  36.25 
 
 
724 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  31.11 
 
 
90 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  40 
 
 
95 aa  61.6  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
89 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.38 
 
 
98 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
82 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.38 
 
 
98 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10530  predicted protein  40.26 
 
 
103 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
124 aa  60.1  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  30.93 
 
 
241 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  38.67 
 
 
112 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  38.67 
 
 
107 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  23.04 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13402  predicted protein  38.75 
 
 
117 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  34.09 
 
 
94 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  24.64 
 
 
151 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  36.46 
 
 
99 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  34.09 
 
 
94 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 
115 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
102 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.48 
 
 
102 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
122 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
104 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
121 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
90 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  26.4 
 
 
288 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  34.57 
 
 
103 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
95 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
114 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
90 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  33.33 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
122 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  35.53 
 
 
123 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
103 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_13471  RNA-binding protein  32.26 
 
 
165 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0775963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.52 
 
 
96 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
90 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
121 aa  57.4  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  34.04 
 
 
98 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
90 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
111 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  28.92 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>