72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01250 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  100 
 
 		 651 aa  1311    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  36.49 
 
 		 547 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  32.56 
 
 		 325 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  37.54 
 
 		 291 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42021  predicted protein  22.35 
 
 		 533 aa  88.6  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  31.11 
 
 		 838 aa  61.6  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  26.09 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  18.64 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  22.13 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10029  predicted protein  27.35 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  30.67 
 
 		 769 aa  54.3  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  24.74 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  28.89 
 
 		 819 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  21.39 
 
 		 481 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  24.52 
 
 		 552 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 122 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 		 88 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 121 aa  50.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  25.16 
 
 		 673 aa  50.4  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 123 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 253 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 124 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 		 250 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  34.72 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  35.06 
 
 		 134 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 		 143 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 		 250 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  28.87 
 
 		 874 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 121 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 149 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 		 173 aa  48.5  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 132 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 152 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  20.1 
 
 		 194 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  32.89 
 
 		 145 aa  48.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  24.65 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 148 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 150 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  21.43 
 
 		 732 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 176 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 90 aa  47.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  23.5 
 
 		 288 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 155 aa  47.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  21.83 
 
 		 605 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 373 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  35.06 
 
 		 151 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 		 196 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 		 98 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 176 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00570  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 		 749 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01188  nuclear mRNA splicing factor-associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10920)  24.9 
 
 		 396 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 480 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  22.99 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  27.03 
 
 		 307 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  36.62 
 
 		 291 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  32 
 
 		 222 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  33.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  25.27 
 
 		 499 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 116 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  25 
 
 		 357 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 		 140 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 175 aa  44.3  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  32.26 
 
 		 559 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 		 202 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 		 245 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 104 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  28.4 
 
 		 128 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  28.4 
 
 		 129 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>