73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06681 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  100 
 
 		 547 aa  1115    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  36.34 
 
 		 651 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  33.53 
 
 		 325 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42021  predicted protein  26.36 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  31.23 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10029  predicted protein  37.04 
 
 		 109 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  26 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  21.95 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  36.11 
 
 		 125 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  38.67 
 
 		 173 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25246  predicted protein  29.79 
 
 		 245 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  32.89 
 
 		 83 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 		 196 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  26.89 
 
 		 687 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 		 143 aa  51.6  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  27.13 
 
 		 233 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 		 145 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  23.74 
 
 		 724 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 104 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  34.72 
 
 		 82 aa  49.7  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  37.33 
 
 		 222 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.67 
 
 		 202 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  34.21 
 
 		 107 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 		 103 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.33 
 
 		 203 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 222 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 250 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 250 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 		 88 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 101 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 217 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  26.7 
 
 		 838 aa  47.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 150 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 		 98 aa  47.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02820  hypothetical protein  29.47 
 
 		 622 aa  47  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0533898  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 148 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 98 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29530  predicted protein  31.58 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145211  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  29.87 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 		 143 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 98 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26750  predicted protein  26 
 
 		 231 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 		 176 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  30.26 
 
 		 143 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 86 aa  45.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 207 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  34.72 
 
 		 81 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  36.11 
 
 		 158 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 		 132 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 104 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  31.25 
 
 		 874 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0508  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 		 65 aa  44.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 152 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0482  HIT family protein  40.74 
 
 		 65 aa  44.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.417177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 87 aa  44.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  31.08 
 
 		 95 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 99 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  31.51 
 
 		 139 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 		 139 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 88 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  38.1 
 
 		 122 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  29.87 
 
 		 151 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  26.32 
 
 		 182 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 		 157 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 		 115 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  28.95 
 
 		 173 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  34.67 
 
 		 97 aa  43.5  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>