157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0144 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01591  RNA recognition motif-containing protein  91.37 
 
 		 139 aa  238  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0697874  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  89.93 
 
 		 139 aa  235  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01701  RNA recognition motif-containing protein  89.21 
 
 		 139 aa  230  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.246938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  64.34 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  61.49 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  56.55 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  55.24 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  57.45 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  59.86 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  39.29 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  36.53 
 
 		 165 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  33.94 
 
 		 166 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  30.25 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  30.52 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  30.52 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  39.24 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.27 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  30.34 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  28.42 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  28.41 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  30.11 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  30.68 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  27.37 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  30.68 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  35.53 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  26.8 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  26.8 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  30 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  30.86 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  28.75 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  28.42 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  31.94 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  27.66 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  27.63 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  32.94 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  31.03 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2998  RNP-1 like RNA-binding protein  23.47 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  26.32 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  28.05 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  27.63 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  27.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  28 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  27.63 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  46.67 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  26.74 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  29.73 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  31.58 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  27.63 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06074  polyadenylation factor subunit CstF64, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09100)  25.88 
 
 		 293 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.4649  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  29.76 
 
 		 724 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  27.08 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  27.63 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  28 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  27.88 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  28.38 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07935  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 320 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  29.73 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  26.73 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  42.22 
 
 		 287 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  29.73 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  30 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  29.07 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>