13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10029 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_10029  predicted protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  38.54 
 
 		 547 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  38.38 
 
 		 325 aa  77.4  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  27.35 
 
 		 651 aa  60.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42021  predicted protein  34.78 
 
 		 533 aa  60.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  45.65 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  26.67 
 
 		 516 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25246  predicted protein  27.37 
 
 		 245 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132508 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 		 615 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25.74 
 
 		 552 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  28.05 
 
 		 687 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01188  nuclear mRNA splicing factor-associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10920)  31.33 
 
 		 396 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04398  G-patch DNA repair protein (Drt111), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06840)  31.63 
 
 		 523 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>