200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02141 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  93.01 
 
 
143 aa  255  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  73.94 
 
 
144 aa  192  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  68.28 
 
 
147 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  64.34 
 
 
145 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  63.83 
 
 
143 aa  183  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  66.43 
 
 
139 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01591  RNA recognition motif-containing protein  67.13 
 
 
139 aa  175  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0697874  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01701  RNA recognition motif-containing protein  65.73 
 
 
139 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.246938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  62.94 
 
 
139 aa  169  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  42.96 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  38.31 
 
 
158 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  37.72 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  34.73 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  33.95 
 
 
164 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  36.6 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
155 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
155 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  37.36 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  41.18 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  39.08 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  28.18 
 
 
552 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
83 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  32.18 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  27.47 
 
 
207 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  30.77 
 
 
441 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  31.58 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  32.53 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.4 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  31.25 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  29.91 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  31.71 
 
 
250 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.95 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.71 
 
 
250 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 
96 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  30.93 
 
 
100 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.09 
 
 
147 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.67 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  34.25 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 
222 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.1 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  36.67 
 
 
291 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  30.14 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  26.88 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  26.88 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  30.14 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.49 
 
 
202 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  27.35 
 
 
296 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  29.35 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  29.27 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  32.05 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  31.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  37.33 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  29.47 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  30.49 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  29.49 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  26.88 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
245 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  31.91 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  29.41 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  31.4 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.33 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0614  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129522  hitchhiker  0.00000043788 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.49 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>