234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1013 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  67.48 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  67.48 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  57.14 
 
 		 165 aa  180  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  56.47 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  53.57 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  51.2 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  43.1 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  37.65 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  36.42 
 
 		 143 aa  97.8  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  37.42 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  33.95 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  34.57 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  33.95 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  30.25 
 
 		 139 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  30.25 
 
 		 139 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01701  RNA recognition motif-containing protein  29.63 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.246938  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01591  RNA recognition motif-containing protein  29.01 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0697874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  40.91 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  40.48 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  39.77 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  42.5 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  40.96 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  34.69 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  40.96 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4004  RNA-binding region RNP-1  64.1 
 
 		 40 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  39.47 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.8 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  37.8 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  39.29 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  39.24 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  34.52 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.8 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  37.8 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  37.35 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  35.06 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  34.18 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.44 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  34.57 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.57 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  35.79 
 
 		 673 aa  53.9  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  32.23 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 		 102 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 		 102 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  37.97 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>