196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26631 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  69.13 
 
 		 145 aa  205  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  70.07 
 
 		 143 aa  202  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  68.28 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  70.75 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  68.97 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01701  RNA recognition motif-containing protein  60 
 
 		 139 aa  166  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.246938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01611  RNA recognition motif-containing protein  58.62 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.950946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01591  RNA recognition motif-containing protein  60.69 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0697874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0144  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  57.24 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0790  RNA-binding region RNP-1  45.21 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.188882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  38.92 
 
 		 165 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1013  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000334324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  39.88 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  39.61 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  35.29 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35.87 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.11 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.63 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  37.63 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  40.51 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  35.53 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  43.06 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  39.47 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  40.22 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  33.68 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  35.16 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  36.46 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  38.82 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.59 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.48 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  35.37 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  33.75 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  32.61 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  36.99 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.58 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  31.71 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  35.11 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  38.89 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  30.68 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  31.87 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  31.25 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.25 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>