263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0614 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0614  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 
101 aa  203  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129522  hitchhiker  0.00000043788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  52.94 
 
 
88 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  49.43 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  48.78 
 
 
87 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  50.59 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  50.59 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  45.88 
 
 
88 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  47.06 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  45.12 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  45.05 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  43.21 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  48.19 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  44.05 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  45.35 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  44.71 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  47.3 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  44.83 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  45.68 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  46.34 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  43.53 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  40.48 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  46.15 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  43.9 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  43.21 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  47.37 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  46.84 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  45.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  42.31 
 
 
85 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  43.21 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  44.3 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  46.34 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  43.59 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  44.58 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  38.2 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  45.12 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  42.86 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  45 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  48.68 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  43.68 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  40.7 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  37.65 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.65 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  42.17 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  43.02 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  44.16 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  44.16 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  40.23 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  46.75 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  42.35 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  44.16 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  40.23 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  41.18 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  46.99 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  45.78 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  40.23 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  45.78 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  43.9 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  43.9 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  39.33 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  39.08 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  40.23 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  38.1 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  40.23 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  41.38 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  40.7 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  36.14 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  42.35 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  44 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  43.53 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  46.75 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  43.53 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>