104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04060 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1234    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.62 
 
 
552 aa  200  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  29.69 
 
 
516 aa  170  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  24.94 
 
 
687 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  30.18 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  19.4 
 
 
651 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  27.31 
 
 
874 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  24.11 
 
 
393 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  31.33 
 
 
524 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  24.78 
 
 
450 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  36 
 
 
107 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  21.14 
 
 
547 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  27.21 
 
 
563 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  35.9 
 
 
143 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
90 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 
373 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  25 
 
 
245 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27744  predicted protein  33.8 
 
 
122 aa  53.9  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0484307 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  34.88 
 
 
497 aa  53.9  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  31.87 
 
 
499 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  36.11 
 
 
837 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
90 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  37.18 
 
 
90 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 
120 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
89 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  31.25 
 
 
202 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  33.33 
 
 
222 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
89 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  27.12 
 
 
279 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  31.25 
 
 
250 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  31.25 
 
 
250 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  50.8  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
114 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
241 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01188  nuclear mRNA splicing factor-associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10920)  27.35 
 
 
396 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 
114 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.29 
 
 
102 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  36.49 
 
 
162 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  30.85 
 
 
101 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
104 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 
245 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
95 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  39.73 
 
 
76 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  24.76 
 
 
484 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  35.21 
 
 
172 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  34.94 
 
 
819 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
99 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.18 
 
 
107 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  34.67 
 
 
102 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
101 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
112 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
90 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  34.18 
 
 
112 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
90 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
90 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11145  predicted protein  21.45 
 
 
325 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
88 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  32.97 
 
 
125 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
87 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
98 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 
97 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.88 
 
 
203 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57807  predicted protein  26.12 
 
 
383 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0302105 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  38.16 
 
 
89 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  30.49 
 
 
196 aa  47.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  36.11 
 
 
288 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
207 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  22.34 
 
 
690 aa  47.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
217 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  25.44 
 
 
291 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  22.96 
 
 
870 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  28.75 
 
 
173 aa  47.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  33.77 
 
 
122 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  24.77 
 
 
424 aa  47.4  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  32.61 
 
 
109 aa  47.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  25.32 
 
 
724 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06030  RNA binding protein, putative  31.82 
 
 
393 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
90 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  34.72 
 
 
155 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  36.71 
 
 
128 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
99 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
86 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 
480 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  36.71 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
88 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
88 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  24.35 
 
 
1290 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02820  hypothetical protein  34.78 
 
 
622 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0533898  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  28.21 
 
 
222 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40911  predicted protein  24.66 
 
 
1453 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844333  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
85 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  32.88 
 
 
838 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04398  G-patch DNA repair protein (Drt111), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06840)  32.35 
 
 
523 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  24.64 
 
 
357 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  30.38 
 
 
221 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
98 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  31.51 
 
 
99 aa  44.3  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  28.89 
 
 
157 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>