100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_8132 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  100 
 
 		 102 aa  207  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27744  predicted protein  66.32 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0484307 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  51.96 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991569 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  48 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  32.58 
 
 		 838 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  29.41 
 
 		 441 aa  50.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.18 
 
 		 724 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  37.08 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  38.46 
 
 		 837 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00109  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11930)  31.4 
 
 		 252 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  30.14 
 
 		 819 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  35.8 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  31.25 
 
 		 455 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  40 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  36.78 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  30.12 
 
 		 524 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 		 253 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.39 
 
 		 552 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  33.8 
 
 		 874 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  29.49 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05779  U1 small nuclear ribonucleoprotein A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06490)  32.91 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.963494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  32.14 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  29.11 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  34.15 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  28.75 
 
 		 563 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00230  RNA binding protein, putative  36.99 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.33 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.65 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_8457  predicted protein  40.68 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13360  predicted protein  34.57 
 
 		 226 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  33.72 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 88 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  35.62 
 
 		 107 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  31.71 
 
 		 122 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  36.11 
 
 		 97 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 121 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 		 89 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.67 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  27.91 
 
 		 484 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01220  cyclophilin, putative  27.91 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  26.39 
 
 		 499 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  29.55 
 
 		 572 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  29.11 
 
 		 769 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2610  RNA-binding protein, RNP-1  33.73 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133872  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  32.97 
 
 		 632 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  28.57 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  32.99 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 96 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  28.17 
 
 		 288 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>