162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03739 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  100 
 
 
484 aa  959    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  49.28 
 
 
563 aa  186  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  31.03 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  47.34 
 
 
222 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  39.2 
 
 
194 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  56.96 
 
 
951 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  56.96 
 
 
931 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  30.61 
 
 
288 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  27.81 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  28 
 
 
673 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  26.38 
 
 
552 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  29.26 
 
 
245 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  24.4 
 
 
632 aa  60.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  38 
 
 
102 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  25.68 
 
 
296 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 
120 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
88 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  25.28 
 
 
837 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  42.68 
 
 
146 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 
615 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7426  predicted protein  44.74 
 
 
81 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.639579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
90 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  39.02 
 
 
105 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  44 
 
 
90 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
87 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  23.16 
 
 
732 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  39.74 
 
 
90 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  37.37 
 
 
102 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  37.37 
 
 
102 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
90 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
89 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 
97 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  42.47 
 
 
81 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
122 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
90 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36.9 
 
 
88 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
88 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  37 
 
 
99 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  46.75 
 
 
85 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  31.11 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
90 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  40.24 
 
 
176 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  39.36 
 
 
94 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  39.36 
 
 
94 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  37 
 
 
101 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  41.56 
 
 
97 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  43.9 
 
 
95 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
83 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  38.96 
 
 
85 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
137 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.34 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  36.26 
 
 
499 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  37.21 
 
 
221 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.46 
 
 
116 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  36.59 
 
 
123 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
149 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
175 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
88 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  24.25 
 
 
319 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  25.58 
 
 
605 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  32.47 
 
 
455 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
121 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
155 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
90 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
110 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  36.9 
 
 
109 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40 
 
 
99 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  36.08 
 
 
98 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 
148 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
121 aa  50.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.08 
 
 
98 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 
150 aa  50.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 
152 aa  50.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  41.1 
 
 
89 aa  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 
140 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  24.87 
 
 
838 aa  50.1  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
95 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
82 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  32.43 
 
 
173 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
157 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  40.24 
 
 
151 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  37.97 
 
 
89 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  40.85 
 
 
92 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
122 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
91 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
176 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  30.63 
 
 
1290 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
181 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  35.9 
 
 
107 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 
253 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
90 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
88 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29370  predicted protein  35.37 
 
 
201 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 
104 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.33 
 
 
112 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.08 
 
 
105 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  31.43 
 
 
241 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  40.24 
 
 
132 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>