75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06030 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  100 
 
 		 563 aa  1133    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  47.34 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  41.51 
 
 		 222 aa  138  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  36.5 
 
 		 194 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  30.1 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  53.25 
 
 		 931 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  53.25 
 
 		 951 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  29.56 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.42 
 
 		 245 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 90 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 		 88 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05268  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 		 266 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  24.44 
 
 		 837 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  26.24 
 
 		 296 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 149 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 		 89 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  36 
 
 		 340 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 		 148 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 132 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  38.64 
 
 		 152 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 155 aa  50.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  33.33 
 
 		 724 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 221 aa  50.4  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  42.62 
 
 		 870 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  33.78 
 
 		 97 aa  50.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  38.57 
 
 		 874 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 157 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 		 150 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 181 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 		 151 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 207 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 122 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  38.96 
 
 		 103 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 176 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  39.73 
 
 		 140 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  23.69 
 
 		 632 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  30 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 116 aa  48.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 		 162 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 176 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7426  predicted protein  38.67 
 
 		 81 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.639579  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  21.05 
 
 		 499 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  24.27 
 
 		 819 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  37.5 
 
 		 119 aa  47.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  33.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  23.53 
 
 		 450 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  32.53 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 		 88 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 102 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  31.03 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 102 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 		 85 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 		 105 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 		 83 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 120 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  27.52 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  25.81 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  37.08 
 
 		 97 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 146 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  37.18 
 
 		 95 aa  44.3  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  35.23 
 
 		 123 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 		 90 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 		 85 aa  44.3  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 122 aa  43.9  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  25 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  24.32 
 
 		 999 aa  43.9  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 137 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 87 aa  43.9  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  27.59 
 
 		 112 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 121 aa  43.5  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 		 104 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>