181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01920 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  100 
 
 		 999 aa  2013    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  33.71 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  31.47 
 
 		 694 aa  168  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  28.66 
 
 		 870 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.8 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  22.88 
 
 		 838 aa  60.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  39.76 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 122 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  28.8 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  40.48 
 
 		 116 aa  57.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  23.75 
 
 		 288 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  27.69 
 
 		 552 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  48.28 
 
 		 83 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  42.65 
 
 		 83 aa  56.2  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  35.48 
 
 		 264 aa  56.2  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  23.65 
 
 		 477 aa  55.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  34.88 
 
 		 499 aa  55.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  41.18 
 
 		 837 aa  54.7  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 		 146 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 		 104 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 85 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  36.71 
 
 		 86 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.34 
 
 		 104 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 		 94 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 89 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 		 109 aa  53.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 		 89 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  39.29 
 
 		 115 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  34.74 
 
 		 107 aa  52.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  39.29 
 
 		 97 aa  53.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 		 87 aa  52.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 		 101 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.36 
 
 		 90 aa  52.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.37 
 
 		 82 aa  52.4  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 		 125 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 150 aa  52.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 149 aa  52.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 99 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 148 aa  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_8457  predicted protein  42.37 
 
 		 59 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 88 aa  52  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  37.35 
 
 		 524 aa  51.6  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  40.3 
 
 		 121 aa  51.6  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 155 aa  51.6  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  52.17 
 
 		 92 aa  51.6  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 		 132 aa  51.2  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  37.21 
 
 		 88 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  41.79 
 
 		 124 aa  51.2  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  24.21 
 
 		 819 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  36.07 
 
 		 95 aa  51.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  24.12 
 
 		 605 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 		 134 aa  50.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 		 102 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 152 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  34.29 
 
 		 314 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 		 157 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  37.04 
 
 		 82 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 		 90 aa  50.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  34.72 
 
 		 91 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  35.63 
 
 		 182 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  33.87 
 
 		 455 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  44.07 
 
 		 158 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  37.31 
 
 		 176 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  36.49 
 
 		 99 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 		 99 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 181 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 		 151 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 		 87 aa  50.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 		 97 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 89 aa  50.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  37.23 
 
 		 90 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  40.3 
 
 		 123 aa  50.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  40.3 
 
 		 122 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 175 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  40.74 
 
 		 194 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 105 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 		 90 aa  49.7  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 		 90 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.81 
 
 		 121 aa  49.7  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 		 86 aa  49.3  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  32.95 
 
 		 161 aa  49.3  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  23.77 
 
 		 572 aa  49.3  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03310  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 708 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 		 88 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 176 aa  48.9  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 196 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  40.32 
 
 		 153 aa  48.9  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  23.97 
 
 		 1290 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 		 90 aa  48.5  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0571  putative RNA binding protein  46.67 
 
 		 78 aa  48.5  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 88 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 98 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  34.62 
 
 		 424 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 98 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  37.18 
 
 		 81 aa  48.5  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.31 
 
 		 140 aa  48.5  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  43.55 
 
 		 195 aa  48.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  36.76 
 
 		 114 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  23.28 
 
 		 769 aa  48.1  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>