30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03310 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03310  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 708 aa  1442    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472473  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26450  predicted protein  28.03 
 
 		 554 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.709727  normal  0.296822 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50310  predicted protein  24.43 
 
 		 699 aa  97.8  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.049035  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04943  hypothetical protein  27 
 
 		 807 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406913  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  32.58 
 
 		 477 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  34.48 
 
 		 999 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  29.41 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.14 
 
 		 102 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  34.12 
 
 		 109 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  32.18 
 
 		 673 aa  47.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  32.58 
 
 		 453 aa  47.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 		 102 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  28.97 
 
 		 328 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  31.76 
 
 		 97 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  32.94 
 
 		 103 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  31.76 
 
 		 103 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 		 104 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  29.41 
 
 		 119 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  31.76 
 
 		 724 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 		 99 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 		 101 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 		 111 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  32.14 
 
 		 97 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  32.94 
 
 		 90 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  29.89 
 
 		 455 aa  44.3  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 105 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  31.76 
 
 		 95 aa  43.9  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>