145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07706 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  100 
 
 
328 aa  645    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  39.76 
 
 
999 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  33.78 
 
 
552 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  37.35 
 
 
102 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
195 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
196 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.33 
 
 
112 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 
253 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
122 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
104 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  33.33 
 
 
107 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  31.03 
 
 
484 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  37.65 
 
 
95 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  35.62 
 
 
81 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  28.24 
 
 
694 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  33.73 
 
 
874 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  33.33 
 
 
497 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  33.65 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03830  hypothetical protein  29.27 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  32.91 
 
 
134 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
90 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  34.12 
 
 
97 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  32.95 
 
 
516 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
221 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06919  RNA annealing protein Yra1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13860)  28.51 
 
 
458 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  29.63 
 
 
455 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  30.77 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
120 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  32.89 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  32.95 
 
 
572 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  36.49 
 
 
107 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  34.67 
 
 
837 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 
110 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
88 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 
90 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  30.59 
 
 
104 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
105 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  27.64 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  31.52 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  32.89 
 
 
95 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01270  U1 snRNP 70K protein (short form), putative  32.88 
 
 
429 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  31.33 
 
 
90 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  30.14 
 
 
632 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  34.25 
 
 
838 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  33.33 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
125 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  30.77 
 
 
1290 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  32.47 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 
101 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  33.33 
 
 
605 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
99 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35114  predicted protein  28.57 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
89 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  33.33 
 
 
86 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  35.62 
 
 
819 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
95 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  40.32 
 
 
84 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
101 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  34.07 
 
 
319 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  35.37 
 
 
94 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 
90 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  31.4 
 
 
157 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  36.76 
 
 
158 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03310  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 
708 aa  45.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472473  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  33.33 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  28.32 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  28.18 
 
 
172 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991569 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  33.78 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  30.56 
 
 
1121 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03240  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  28.17 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  28 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  34.52 
 
 
109 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  35.14 
 
 
107 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
196 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  28.95 
 
 
116 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
94 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
94 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  28.95 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
104 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  32.84 
 
 
122 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  45.83 
 
 
129 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
115 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  40.28 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  24 
 
 
732 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05100  RNA binding protein, putative  29.63 
 
 
123 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
98 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  30.14 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  30.26 
 
 
134 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.88 
 
 
82 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 
114 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>