155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03760 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  100 
 
 
1121 aa  2306    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  24.03 
 
 
1290 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47305  U4/U6 snRNA-associated splicing factor  25.88 
 
 
837 aa  136  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0758883  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2998  RNP-1 like RNA-binding protein  34.38 
 
 
100 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  32.94 
 
 
94 aa  60.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
109 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.61 
 
 
99 aa  58.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
104 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
101 aa  57.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  28.48 
 
 
559 aa  57.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 
95 aa  57  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
97 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
90 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  25.97 
 
 
245 aa  56.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
103 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
110 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
85 aa  55.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
98 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
98 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  32.98 
 
 
161 aa  54.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3920  RNA-binding protein  41.33 
 
 
78 aa  53.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  38.27 
 
 
250 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  30.3 
 
 
119 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  38.96 
 
 
112 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.27 
 
 
250 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
99 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  23.5 
 
 
441 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
103 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
103 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
111 aa  53.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.21 
 
 
105 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00255  RNA binding protein  31.62 
 
 
226 aa  53.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
102 aa  52.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
102 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  36.78 
 
 
151 aa  52.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  29.7 
 
 
107 aa  52.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  36.63 
 
 
195 aa  52.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
92 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
99 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
92 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  29.93 
 
 
874 aa  52  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
153 aa  52  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  34.62 
 
 
160 aa  52  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
87 aa  52  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
82 aa  51.6  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
154 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
253 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
196 aa  51.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.8 
 
 
196 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
114 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
88 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
89 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
96 aa  51.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  34.44 
 
 
89 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
241 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  29.03 
 
 
221 aa  50.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  33.33 
 
 
107 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  34.18 
 
 
95 aa  50.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
88 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  50.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
151 aa  50.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.63 
 
 
115 aa  50.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  33.33 
 
 
149 aa  49.7  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  35.92 
 
 
108 aa  49.7  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
89 aa  49.7  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
89 aa  49.7  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.57 
 
 
202 aa  49.7  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
117 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  23.79 
 
 
352 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  31.78 
 
 
307 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  36.36 
 
 
107 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
91 aa  49.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
162 aa  49.3  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
245 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  32.94 
 
 
98 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.18 
 
 
724 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  33.77 
 
 
497 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
173 aa  48.9  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
147 aa  48.9  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  31.4 
 
 
127 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
137 aa  48.9  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  39.66 
 
 
102 aa  48.9  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  30.68 
 
 
87 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  37.04 
 
 
222 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  33.77 
 
 
173 aa  48.9  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  23.37 
 
 
632 aa  48.5  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
114 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
90 aa  48.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  28.74 
 
 
97 aa  48.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  47.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
90 aa  47.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  32.98 
 
 
152 aa  48.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  32.67 
 
 
155 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>