177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07350 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  100 
 
 
497 aa  982    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  34.59 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  35.56 
 
 
439 aa  87  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  46.43 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  41.46 
 
 
97 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25349  predicted protein  37.11 
 
 
282 aa  63.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  40.24 
 
 
102 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 
196 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
87 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 
195 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  40.48 
 
 
245 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
88 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
88 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 
134 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  36.49 
 
 
155 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
85 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  40.91 
 
 
87 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  40.24 
 
 
89 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  38.46 
 
 
524 aa  57  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  38.36 
 
 
144 aa  57  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  41.33 
 
 
127 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
89 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
90 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  36.49 
 
 
217 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
90 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  38.89 
 
 
210 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
109 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
82 aa  54.7  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
83 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43274  predicted protein  32.63 
 
 
352 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.758064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
86 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  38.96 
 
 
151 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.02 
 
 
109 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
88 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
90 aa  53.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
104 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  36.9 
 
 
99 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
146 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  35.14 
 
 
97 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
89 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  36.11 
 
 
187 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  41.77 
 
 
107 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
221 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
101 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  38.04 
 
 
108 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67695  suppressor of DNA polymerase and splicing mutations  30.06 
 
 
818 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  37.35 
 
 
86 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31221  predicted protein  34.52 
 
 
727 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.005519  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  38.03 
 
 
279 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
91 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  39.02 
 
 
95 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 
89 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
90 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
92 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
92 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
88 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  36.99 
 
 
76 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  34.15 
 
 
90 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  35.87 
 
 
114 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 
253 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  36.25 
 
 
143 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  43.59 
 
 
95 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  28.99 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  36.71 
 
 
161 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  39.51 
 
 
97 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  33.7 
 
 
154 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  30.77 
 
 
516 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  29.06 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  34.31 
 
 
328 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  36.92 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.78 
 
 
112 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  33.77 
 
 
1121 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  32.2 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  33.78 
 
 
107 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
115 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  34.18 
 
 
128 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  34.18 
 
 
129 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.94 
 
 
724 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  35.06 
 
 
287 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
98 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
98 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
81 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
99 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  31.86 
 
 
155 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.84 
 
 
116 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
156 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  34.23 
 
 
357 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  32.43 
 
 
91 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 
94 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  33.72 
 
 
105 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  33.75 
 
 
246 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
122 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>