96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44442 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  100 
 
 		 269 aa  560  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  25.97 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  26.07 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  26.32 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  27.47 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25.99 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  25.43 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  23.66 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  22.61 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  24.36 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  24.73 
 
 		 838 aa  57  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  36.78 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  25.3 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  23.03 
 
 		 450 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  26.04 
 
 		 1290 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44395  predicted protein  34.29 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00014935  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59522  predicted protein  28.57 
 
 		 447 aa  52.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  21.05 
 
 		 559 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  28.26 
 
 		 605 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  30.91 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 110 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 		 82 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32.14 
 
 		 196 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  28.5 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  27.5 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01270  U1 snRNP 70K protein (short form), putative  31.82 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  33.73 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  34.67 
 
 		 497 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00255  RNA binding protein  30.69 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  36.59 
 
 		 86 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 83 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  34.21 
 
 		 439 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  27.5 
 
 		 92 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  32.43 
 
 		 107 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  30 
 
 		 81 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  31.58 
 
 		 92 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  34.94 
 
 		 151 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 		 203 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  23.6 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  32.43 
 
 		 112 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.49 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  29.76 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49387  predicted protein  21.13 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  23 
 
 		 732 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  32.91 
 
 		 125 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  28.75 
 
 		 87 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  37.18 
 
 		 455 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  27.66 
 
 		 314 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  31.75 
 
 		 97 aa  45.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  30.65 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  29.49 
 
 		 99 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  22.45 
 
 		 632 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32 
 
 		 89 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49481  predicted protein  27.55 
 
 		 1068 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  27.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  27.96 
 
 		 98 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  32 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  30.77 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  33.98 
 
 		 584 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7191  predicted protein  36.51 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.373889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.76 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  30.85 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  24.44 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  22.13 
 
 		 615 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  35.48 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.49 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  28 
 
 		 96 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  23.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  29.79 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  27.87 
 
 		 572 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  30.23 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  35 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  29.76 
 
 		 819 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  28 
 
 		 102 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1121 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 		 89 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  28.12 
 
 		 86 aa  42.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  34.43 
 
 		 176 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01188  nuclear mRNA splicing factor-associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10920)  27.81 
 
 		 396 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31221  predicted protein  29.73 
 
 		 727 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.005519  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  28.19 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  26.74 
 
 		 88 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  29.33 
 
 		 104 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00592  RNA binding protein MSSP-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11030)  22.89 
 
 		 608 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000179552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  28 
 
 		 97 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>