28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00790 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  100 
 
 		 584 aa  1165    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59522  predicted protein  25.3 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01452  Nucleolar protein 12 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDC8]  27.04 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.04661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  29 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  35.11 
 
 		 246 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  29.73 
 
 		 291 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 		 88 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  32.31 
 
 		 225 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.94 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  31.96 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  30.93 
 
 		 153 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  32.58 
 
 		 89 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.83 
 
 		 88 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  33.98 
 
 		 269 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  34.74 
 
 		 160 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  31.18 
 
 		 187 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  28.71 
 
 		 152 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  29.29 
 
 		 210 aa  44.3  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  28.41 
 
 		 88 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>