74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_13679 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59522  predicted protein  35.11 
 
 		 447 aa  72  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  35.45 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01452  Nucleolar protein 12 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDC8]  33.83 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.04661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  32.31 
 
 		 584 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  30.91 
 
 		 453 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  34.07 
 
 		 88 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  31.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  33.33 
 
 		 441 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  27.18 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.11 
 
 		 88 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  35.44 
 
 		 552 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  29.67 
 
 		 87 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.93 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  32.61 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 89 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 94 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  31.49 
 
 		 512 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.93 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.22 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  34.78 
 
 		 90 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05110  RNA binding protein, putative  34.12 
 
 		 364 aa  45.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  32.22 
 
 		 176 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 		 89 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 104 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  32.5 
 
 		 439 aa  45.1  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  30.95 
 
 		 134 aa  45.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  35.37 
 
 		 497 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  32.22 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  31.11 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  31.11 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  32.97 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 103 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  31.52 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  30.95 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  25.88 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  29.67 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  28.16 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.97 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  25.81 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  32.97 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  30 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 		 83 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  29.67 
 
 		 108 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.03 
 
 		 143 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 		 88 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.53 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  26.89 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  32.22 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  34.52 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 98 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 99 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  29.89 
 
 		 81 aa  42  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 		 82 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  28.89 
 
 		 121 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  28.89 
 
 		 121 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 158 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  37.04 
 
 		 353 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 		 373 aa  42  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32.97 
 
 		 196 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.53 
 
 		 222 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  28.05 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.53 
 
 		 99 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  31.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 152 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>