20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59522 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_59522  predicted protein  100 
 
 		 447 aa  891    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01452  Nucleolar protein 12 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDC8]  33.06 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.04661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  34.39 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  25.3 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  35.11 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  28.57 
 
 		 269 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  23.98 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00210  RNA-binding protein sce3, putative  26.04 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  35.82 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  30.95 
 
 		 187 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  33.33 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  40 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  34.43 
 
 		 155 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  20.81 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  32.98 
 
 		 128 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  30.77 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  32.98 
 
 		 129 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  34.43 
 
 		 151 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  26.29 
 
 		 245 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  32.63 
 
 		 246 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>