108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46145 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  100 
 
 		 393 aa  794    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59522  predicted protein  34.39 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.77 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  28.96 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  35.45 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  37.18 
 
 		 86 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01452  Nucleolar protein 12 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDC8]  27.56 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.04661  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  41.98 
 
 		 187 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  36.25 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  33 
 
 		 524 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  33.33 
 
 		 724 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  26.05 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 89 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  37.66 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  29.75 
 
 		 158 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  23.47 
 
 		 552 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  24.79 
 
 		 632 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33658  predicted protein  30.93 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  30.38 
 
 		 87 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  33.75 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  31.4 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  32.91 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  34.18 
 
 		 91 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  37.97 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 111 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 102 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  25.78 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  25.12 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 102 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 86 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  37.33 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  30.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  33.33 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 101 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  28.09 
 
 		 207 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  26.88 
 
 		 161 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 		 88 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 88 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 		 88 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  31.46 
 
 		 870 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.71 
 
 		 114 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  23.78 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03577  RNA-binding protein  30.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000014599  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04748  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06310)  38.67 
 
 		 339 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311535  normal  0.626958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  30.49 
 
 		 109 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  34.57 
 
 		 497 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 		 103 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 		 82 aa  46.6  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  28.36 
 
 		 874 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  32.91 
 
 		 152 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  30.23 
 
 		 999 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  30.49 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 99 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  30.68 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 90 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  31.25 
 
 		 161 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.34 
 
 		 115 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  30.77 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 110 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  28.75 
 
 		 88 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 88 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 101 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  22.34 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05110  RNA binding protein, putative  30.77 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  26.81 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 		 88 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 		 121 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  29.27 
 
 		 99 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  31.01 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35.82 
 
 		 116 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  28.21 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  39.68 
 
 		 694 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 		 104 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  21.25 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.48 
 
 		 98 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 98 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  30.48 
 
 		 98 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  25.97 
 
 		 148 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 		 102 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  25.97 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  33.75 
 
 		 155 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  35.09 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.84 
 
 		 90 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 		 90 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 121 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  22.73 
 
 		 122 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  23.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  23.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 		 165 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  29.87 
 
 		 107 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00255  RNA binding protein  34.55 
 
 		 226 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  37.18 
 
 		 97 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  27.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  21.89 
 
 		 572 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 90 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  22.6 
 
 		 304 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>