48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05110 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB05110  RNA binding protein, putative  100 
 
 		 364 aa  721    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  24.52 
 
 		 499 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  36.9 
 
 		 115 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.57 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  27.81 
 
 		 572 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 102 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 102 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 		 122 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  42.5 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.52 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.1 
 
 		 552 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  35.63 
 
 		 122 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 85 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 148 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 150 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 175 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 94 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 		 94 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 149 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.93 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13679  predicted protein  34.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249482  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  32.95 
 
 		 838 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  31.46 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.312591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  30.34 
 
 		 108 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  30.77 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  30.95 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  36.25 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 		 125 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  30 
 
 		 86 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 		 132 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1143 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  35.21 
 
 		 97 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  31.03 
 
 		 453 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 		 124 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 		 207 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.94 
 
 		 181 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.94 
 
 		 134 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 		 103 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00109  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11930)  30.83 
 
 		 252 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.94 
 
 		 151 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 120 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>