127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06380 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  52.73 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991569 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27744  predicted protein  50.52 
 
 
122 aa  99  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0484307 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  48 
 
 
102 aa  92  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  42.11 
 
 
484 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  31.37 
 
 
441 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  33.73 
 
 
838 aa  58.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  33.33 
 
 
673 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.33 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  36.76 
 
 
572 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  33.77 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00109  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11930)  31.67 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  33.8 
 
 
552 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 
615 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  30.59 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  31.76 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
444 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  37.7 
 
 
328 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  33.73 
 
 
245 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  36.36 
 
 
524 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  28.24 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  33.75 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  25.88 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  35.71 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  31.51 
 
 
819 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  26.83 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  38.96 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  36.67 
 
 
632 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  30.99 
 
 
874 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06903  U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa (AFU_orthologue; AFUA_5G13480)  30.59 
 
 
373 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1198  normal  0.976226 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  29.07 
 
 
732 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.48 
 
 
724 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  36.36 
 
 
999 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  33.87 
 
 
314 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  33.77 
 
 
563 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  33.33 
 
 
605 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  27.59 
 
 
769 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  32.5 
 
 
184 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  34.33 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  29.59 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  30.86 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  27.06 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  29.89 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  29.03 
 
 
951 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  29.03 
 
 
931 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  27.38 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  32.22 
 
 
269 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.312591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  36.11 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  32.95 
 
 
837 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  30.34 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  31.08 
 
 
870 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
253 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  30 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  31.17 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  34.78 
 
 
424 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  36.11 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  27.06 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  30.99 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  37.31 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  30.68 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  34.48 
 
 
1290 aa  44.3  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  27.38 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01270  U1 snRNP 70K protein (short form), putative  31.51 
 
 
429 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  29.63 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  30.51 
 
 
694 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  36.59 
 
 
1121 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.18 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  27.71 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  26.19 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  34.72 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  33.78 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  30 
 
 
246 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1253  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000895095  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  31.51 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  30.16 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  27.5 
 
 
104 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  31.17 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  26.83 
 
 
103 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
155 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  27.5 
 
 
81 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  30.49 
 
 
499 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>