224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8445 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  100 
 
 
67 aa  137  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  51.52 
 
 
499 aa  80.1  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  44.62 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  44.62 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  43.08 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  43.08 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  41.54 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  41.54 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  43.28 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
175 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  41.54 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  43.08 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  41.54 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  43.75 
 
 
632 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  36.92 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  41.94 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  40.32 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  40.32 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  48.08 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  36.92 
 
 
605 aa  55.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 
373 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  41.27 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40.32 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  38.46 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  41.94 
 
 
222 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 
444 aa  54.7  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  40.32 
 
 
102 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.36 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  40.32 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  40.32 
 
 
217 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
245 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  35.38 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  37.29 
 
 
559 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  33.33 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
250 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.92 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.1 
 
 
250 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
125 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  38.46 
 
 
673 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  39.68 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.31 
 
 
157 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  38 
 
 
481 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.51 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.92 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  36.51 
 
 
196 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  34.38 
 
 
245 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  39.71 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  35.48 
 
 
524 aa  50.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  34.43 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  35.82 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  38.46 
 
 
572 aa  50.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  35.82 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  39.68 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  31.75 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  37.5 
 
 
732 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  40 
 
 
552 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  40.91 
 
 
319 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  39.68 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.92 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  31.25 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  31.75 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  32.81 
 
 
279 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  33.87 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  42.86 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  30.16 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7586  predicted protein  28.57 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.561304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.16 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  33.87 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.1 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  31.75 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  37.1 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  33.87 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  35.94 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  38.71 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  37.1 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  39.34 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>