120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02310 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  904    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  39.82 
 
 
632 aa  79.7  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  39.56 
 
 
673 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  40.66 
 
 
732 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  40.22 
 
 
572 aa  70.1  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  41.46 
 
 
605 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 
176 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  36.73 
 
 
101 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  48.53 
 
 
319 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
137 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
104 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
149 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.9 
 
 
181 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
155 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
132 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
175 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  36.59 
 
 
162 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 
151 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 
82 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  37.8 
 
 
176 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
148 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
150 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
152 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
90 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
102 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
102 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 
89 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
157 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
121 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  36.05 
 
 
123 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  35.71 
 
 
352 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 
90 aa  57  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.56 
 
 
134 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.1 
 
 
121 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  34.88 
 
 
140 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
85 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  31.43 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 
87 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 
82 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7586  predicted protein  33.73 
 
 
150 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.561304  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  39.19 
 
 
499 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  39.06 
 
 
67 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  31.18 
 
 
552 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
115 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  36.47 
 
 
90 aa  53.9  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  38.1 
 
 
114 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
122 aa  53.5  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
90 aa  53.5  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  35.06 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
122 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.91 
 
 
116 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
125 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  26.85 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  34.94 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  38.55 
 
 
87 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  34.52 
 
 
103 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  33.8 
 
 
837 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
88 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  39.19 
 
 
477 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  38.89 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  42.86 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
120 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
89 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  35.44 
 
 
95 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40.85 
 
 
99 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
124 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  35.87 
 
 
128 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  40.98 
 
 
724 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  31.71 
 
 
694 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
92 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  28.95 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
83 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
146 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  43.14 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  29.27 
 
 
874 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  35.53 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  34.34 
 
 
119 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
90 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0508  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
65 aa  48.5  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  34.09 
 
 
160 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  34.15 
 
 
90 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  32.14 
 
 
105 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  31.17 
 
 
319 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  44.9 
 
 
218 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  40 
 
 
559 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
95 aa  47.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0482  HIT family protein  35.94 
 
 
65 aa  47  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.417177  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  41.94 
 
 
90 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
85 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  42.86 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
91 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  30 
 
 
480 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
88 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
88 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  32 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
101 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  30.14 
 
 
152 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>