228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04610 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  67 
 
 
352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  61.62 
 
 
319 aa  271  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  51.15 
 
 
328 aa  230  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  42.52 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  32.43 
 
 
673 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  30.86 
 
 
605 aa  106  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  35.8 
 
 
572 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  34.5 
 
 
434 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  32.16 
 
 
732 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  28.25 
 
 
477 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  28.05 
 
 
632 aa  86.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  29.48 
 
 
453 aa  85.9  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  31.69 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  25.38 
 
 
687 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  26.88 
 
 
441 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  29.25 
 
 
481 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  24.46 
 
 
245 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  26.37 
 
 
499 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  29.19 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  26.94 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  26.58 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  26.23 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
480 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  36.78 
 
 
152 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
173 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  25.25 
 
 
690 aa  56.6  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
105 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  35.9 
 
 
128 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  36.84 
 
 
182 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40.79 
 
 
99 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  33.77 
 
 
95 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.04 
 
 
82 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  37.08 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
95 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
95 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  35.06 
 
 
104 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
102 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  26.44 
 
 
446 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
104 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  22.18 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
114 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 
134 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
99 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.21 
 
 
90 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
95 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
149 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  28.9 
 
 
706 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  25 
 
 
151 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
148 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 
207 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
155 aa  52.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  36.36 
 
 
153 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 
157 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
98 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.07 
 
 
94 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  36.84 
 
 
149 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
90 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
98 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  36.47 
 
 
151 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
132 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  38.46 
 
 
524 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
102 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05100  RNA binding protein, putative  31.71 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
90 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
104 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  35.06 
 
 
119 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
90 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
162 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 
103 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
90 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4552  RNP-1 like RNA-binding protein  34.74 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  34.21 
 
 
724 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  22.15 
 
 
559 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  29.76 
 
 
86 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 
151 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 
202 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  31.03 
 
 
155 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  38.36 
 
 
128 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
222 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  35.29 
 
 
89 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
97 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
147 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  35.53 
 
 
76 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
88 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  35.23 
 
 
154 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  35.23 
 
 
154 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  36.84 
 
 
154 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
160 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
175 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  32.14 
 
 
97 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>