23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04890 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 706 aa  1449    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07480  differentiation regulator (Nrd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05670)  51.24 
 
 		 830 aa  449  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.635834 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67503  predicted protein  41.52 
 
 		 619 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.50882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67901  predicted protein  36.63 
 
 		 1257 aa  141  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29004  normal  0.614914 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05962  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 340 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597543  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  24.57 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 		 1221 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  26.09 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  25.1 
 
 		 673 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  26 
 
 		 632 aa  54.3  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  28.3 
 
 		 352 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 		 304 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47218  predicted protein  23.22 
 
 		 239 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0377977  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  23.9 
 
 		 161 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  27.78 
 
 		 319 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 		 90 aa  47.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  22.17 
 
 		 499 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  22.22 
 
 		 434 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  21.11 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  33.82 
 
 		 218 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 		 82 aa  45.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  36.21 
 
 		 161 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41266  predicted protein  28.38 
 
 		 386 aa  43.9  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0574303  normal  0.0646612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>