48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07480 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07480  differentiation regulator (Nrd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05670)  100 
 
 		 830 aa  1692    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.635834 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67503  predicted protein  59.13 
 
 		 619 aa  517  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.50882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  51.88 
 
 		 706 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67901  predicted protein  45.58 
 
 		 1257 aa  178  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29004  normal  0.614914 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05962  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 		 340 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597543  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  23.24 
 
 		 477 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  22.22 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 1221 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  23.03 
 
 		 572 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  21.07 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  28.87 
 
 		 155 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  22.33 
 
 		 732 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  19.13 
 
 		 605 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 		 90 aa  51.6  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.21 
 
 		 90 aa  51.2  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  22.35 
 
 		 450 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  39.34 
 
 		 90 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  33.72 
 
 		 90 aa  48.5  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  24.55 
 
 		 453 aa  48.5  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 90 aa  48.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  37.93 
 
 		 112 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  25.75 
 
 		 161 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41266  predicted protein  32.43 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0574303  normal  0.0646612 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  35.38 
 
 		 1175 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 89 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47218  predicted protein  25.24 
 
 		 239 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0377977  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  34.43 
 
 		 90 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  35.38 
 
 		 149 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 		 90 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  28.57 
 
 		 152 aa  45.8  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  28.89 
 
 		 387 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 99 aa  45.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  30.17 
 
 		 153 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 		 151 aa  45.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  33.72 
 
 		 90 aa  45.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  25.74 
 
 		 632 aa  45.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  35.29 
 
 		 154 aa  45.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  30 
 
 		 105 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 154 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 		 86 aa  44.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 154 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 		 154 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.38 
 
 		 147 aa  44.3  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>