131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05100 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC05100  RNA binding protein, putative  100 
 
 
123 aa  256  7e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247745  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  50 
 
 
158 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9485  predicted protein  50 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0359849  normal  0.11207 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20716  predicted protein  50.59 
 
 
138 aa  90.5  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  35.87 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  33.71 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  29.35 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  34.21 
 
 
264 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  30.34 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  26.51 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  30.34 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  34.18 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
101 aa  53.5  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.23 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  32.95 
 
 
250 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  32.95 
 
 
250 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.2 
 
 
202 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  30.59 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
304 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  32.89 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  30.67 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  27.71 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.29 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  26.74 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  28.24 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  31.94 
 
 
288 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  30.67 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  30.67 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  34.25 
 
 
289 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  29.47 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  29.33 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 
95 aa  48.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  34.12 
 
 
874 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3507  predicted protein  28.95 
 
 
330 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  30.26 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
245 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  29.11 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  28.95 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  30.09 
 
 
352 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  27.27 
 
 
477 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  29.76 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  34.67 
 
 
222 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  24.14 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  27.17 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  29.63 
 
 
328 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  27.59 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  31.58 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  29.29 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  24.74 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  29.17 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  30.67 
 
 
461 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  32.47 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  34.25 
 
 
605 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  26.51 
 
 
279 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  28.24 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  29.76 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.67 
 
 
203 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  32.18 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  30.67 
 
 
222 aa  43.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  31.13 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  27.71 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  26.03 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  29.11 
 
 
453 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  28.21 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  28.21 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2610  RNA-binding protein, RNP-1  32.88 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  31.51 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  28.21 
 
 
819 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04870  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
504 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  27.16 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>