156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50467 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  52.38 
 
 
187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  50.37 
 
 
144 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  48.37 
 
 
155 aa  118  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  41.55 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  51.72 
 
 
97 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
88 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
101 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  39.36 
 
 
89 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
87 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
102 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
110 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
99 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
97 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
146 aa  58.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
89 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.19 
 
 
109 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
94 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
94 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  32.91 
 
 
134 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  33.33 
 
 
497 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
97 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 
94 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
92 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
88 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
92 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
98 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
98 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  35.44 
 
 
107 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
90 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
109 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
91 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  29.82 
 
 
173 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
90 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  41.89 
 
 
111 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
99 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
85 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
86 aa  55.1  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
102 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  35.9 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
105 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4015  RNA-binding region RNP-1  35.29 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000301969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
85 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
98 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  32.43 
 
 
90 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
99 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  31.17 
 
 
95 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
104 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
89 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
88 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
88 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
196 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.25 
 
 
76 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  30.93 
 
 
207 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
88 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
103 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  29.73 
 
 
100 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  31.65 
 
 
81 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  28.92 
 
 
89 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  32.05 
 
 
86 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  28.38 
 
 
724 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  33.9 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  30.43 
 
 
687 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
103 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 
88 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  28.95 
 
 
87 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  30.23 
 
 
160 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  30.12 
 
 
90 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
101 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
114 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  32.65 
 
 
98 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  30.43 
 
 
769 aa  50.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  27.91 
 
 
112 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
92 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 
122 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  28.41 
 
 
91 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  29.49 
 
 
107 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
82 aa  48.9  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
104 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  33.75 
 
 
393 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.4 
 
 
441 aa  48.5  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  33.77 
 
 
103 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
96 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  31.33 
 
 
151 aa  48.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  31.08 
 
 
143 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
108 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
82 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
102 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05100  RNA binding protein, putative  23.58 
 
 
123 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  29.73 
 
 
90 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 
90 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 
88 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  29.33 
 
 
387 aa  46.6  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  33.33 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>