107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_7571 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_7571  predicted protein  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50467  predicted protein  50.37 
 
 
217 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  44.97 
 
 
210 aa  122  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  47.33 
 
 
187 aa  120  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  56.67 
 
 
155 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  55.29 
 
 
97 aa  100  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  46.75 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07350  translation initiation factor 4B (AFU_orthologue; AFUA_2G16400)  38.36 
 
 
497 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628412  normal  0.665628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  44 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  41.89 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  41.25 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  43.24 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  43.24 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  42.67 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  40.51 
 
 
107 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
90 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 
99 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  28.79 
 
 
441 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.67 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  36.14 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  31.33 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
207 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  39.19 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  36.49 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
82 aa  47  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 
99 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  26.14 
 
 
552 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  29.27 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  35.62 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  28.41 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
96 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  37.5 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  32.93 
 
 
450 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  35.14 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42846  predicted protein  33.75 
 
 
516 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.54724 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  36.62 
 
 
288 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  30.38 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  35.9 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  33.8 
 
 
870 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  33.73 
 
 
572 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  35.62 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  30.26 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7923  predicted protein  35.48 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00469197 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_7913  predicted protein  35.48 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189253  hitchhiker  0.00110765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  42.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35048  predicted protein  28.4 
 
 
362 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  28.05 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  23.75 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  35.14 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.81 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
157 aa  42  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  32.39 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  32.91 
 
 
328 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  30.56 
 
 
819 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  30.95 
 
 
1121 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  28.41 
 
 
837 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>