214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_8174 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  35.05 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  41.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  41.33 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  41.1 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  40.96 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  36.71 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.73 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  34.38 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40.54 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  36 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  39.13 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.61 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.61 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  38.24 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  38.24 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  39.71 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.76 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  34.18 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  35.79 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  44.12 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.52 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  39.71 
 
 
175 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  35.16 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  39.73 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  35.16 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  39.71 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 
181 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  34.38 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  39.71 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  40.85 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.95 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12366  predicted protein  37.04 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  32.58 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  35.53 
 
 
441 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  34.72 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.87 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  34.62 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  32.43 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  36.49 
 
 
289 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
250 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  35.9 
 
 
222 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  33.82 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
250 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.25 
 
 
94 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  36.76 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  36.62 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  29.76 
 
 
632 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  40.98 
 
 
264 aa  53.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
245 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  34.09 
 
 
477 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  36.99 
 
 
874 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
222 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  34.94 
 
 
1290 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  41.43 
 
 
84 aa  52  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  32.94 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.29 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  29.27 
 
 
732 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.58 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>