96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27744 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_27744  predicted protein  100 
 
 		 122 aa  254  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0484307 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  53.21 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991569 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  66.32 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06380  conserved hypothetical protein  50.52 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 615 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00109  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11930)  28.42 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766203 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  29.03 
 
 		 838 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05779  U1 small nuclear ribonucleoprotein A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06490)  31.25 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.963494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  34.18 
 
 		 441 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  37.84 
 
 		 524 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  36.67 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  32.89 
 
 		 484 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  28.24 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  33.33 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  35.71 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  29.57 
 
 		 724 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  27.38 
 
 		 769 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  30 
 
 		 455 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  30.21 
 
 		 572 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  28.77 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00230  RNA binding protein, putative  37.84 
 
 		 285 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  30.59 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12366  predicted protein  29.55 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  35.62 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  31.46 
 
 		 563 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  28.57 
 
 		 328 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  30.95 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  31.08 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  36.11 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  33.77 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  25.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  33.77 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  27.4 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  24.66 
 
 		 819 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  28.95 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  28.77 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  29.17 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  35.62 
 
 		 149 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06903  U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa (AFU_orthologue; AFUA_5G13480)  30.49 
 
 		 373 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1198  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01460  eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 4 delta, 44kDa, putative  31.25 
 
 		 290 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 176 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  31.11 
 
 		 95 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  31.58 
 
 		 173 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  29.17 
 
 		 151 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  33.87 
 
 		 874 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 150 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  27.78 
 
 		 149 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  31.94 
 
 		 837 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  26.27 
 
 		 328 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  34.38 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  28.05 
 
 		 289 aa  41.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  27.78 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0352  RNP-1 like RNA-binding protein  30.85 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0296626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  32.53 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  29.17 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  29.17 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  29.17 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  31.94 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  29.17 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00800  conserved hypothetical protein  43.24 
 
 		 396 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.619806  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  27.37 
 
 		 632 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  30.14 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  31.51 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_8457  predicted protein  32.2 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  27.4 
 
 		 499 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  29.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40739  predicted protein  29.41 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  27.4 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  24.39 
 
 		 732 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  30.56 
 
 		 157 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  30.14 
 
 		 114 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  32.2 
 
 		 314 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>