115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL03800 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  100 
 
 
951 aa  1894    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  97.9 
 
 
931 aa  1729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  53.25 
 
 
563 aa  91.3  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  56.96 
 
 
484 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  55.56 
 
 
424 aa  88.6  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  50.59 
 
 
194 aa  82  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  43.75 
 
 
222 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  41.56 
 
 
288 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 
155 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  44.58 
 
 
149 aa  59.3  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  40.48 
 
 
137 aa  58.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  42.35 
 
 
97 aa  58.5  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  27.43 
 
 
632 aa  57.8  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  46.75 
 
 
146 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  44.58 
 
 
140 aa  56.6  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
82 aa  57  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
90 aa  57  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 
99 aa  55.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
132 aa  55.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  43.42 
 
 
176 aa  55.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  41.67 
 
 
134 aa  54.7  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  39.56 
 
 
160 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  42.86 
 
 
151 aa  54.3  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
121 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
121 aa  54.3  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  44.87 
 
 
151 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
175 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
160 aa  52.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
181 aa  53.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  39.18 
 
 
161 aa  53.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  46.25 
 
 
95 aa  52.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  21.74 
 
 
673 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  40.51 
 
 
119 aa  52.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
148 aa  52.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
176 aa  52.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
122 aa  52  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  42.17 
 
 
162 aa  52  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
122 aa  52  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 
105 aa  51.6  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  41.56 
 
 
123 aa  51.6  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
97 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 
152 aa  51.6  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  21.43 
 
 
732 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
90 aa  51.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
150 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
154 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  35.63 
 
 
114 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
154 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
154 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03577  RNA-binding protein  33.96 
 
 
154 aa  50.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000014599  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
154 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
102 aa  50.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  41.03 
 
 
149 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
102 aa  50.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
151 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
156 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
154 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
154 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
147 aa  49.7  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  41.03 
 
 
155 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  40.96 
 
 
157 aa  49.7  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  38.46 
 
 
81 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  41.56 
 
 
152 aa  48.9  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
90 aa  49.3  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  39.74 
 
 
319 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  35.54 
 
 
153 aa  48.5  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
98 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  36.54 
 
 
154 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
124 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
98 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  35.14 
 
 
96 aa  48.5  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36.49 
 
 
90 aa  48.1  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  34.48 
 
 
340 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 
103 aa  48.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  38.36 
 
 
264 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
94 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  41.03 
 
 
154 aa  47.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
92 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
103 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 
102 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  34.15 
 
 
572 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  40 
 
 
152 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
95 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
105 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
94 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  39.19 
 
 
92 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07456  pre-mRNA branch site protein p14, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05960)  36.71 
 
 
172 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00282  RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02950)  35.71 
 
 
418 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00846667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  34.57 
 
 
108 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  34.15 
 
 
114 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
103 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
90 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
88 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  39.66 
 
 
221 aa  46.6  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
110 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  27.85 
 
 
455 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  31.4 
 
 
90 aa  45.8  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.65 
 
 
116 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  33.78 
 
 
76 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>